W zasobie archiwalnym Koła znajdują się materiały wytworzone i zgromadzone w wyniku jego działalności. Są to regulaminy, statuty, deklaracje członkowskie, sprawozdania, plany pracy, dokumentacja konferencji, sesji, kongresów, seminariów oraz obozów naukowych, a także korespondencja z władzami uczelni, Zrzeszeniem Studentów Polskich oraz innymi ośrodkami historycznymi. Zgromadzone materiały obejmują również materiały do publikacji pokonferencyjnych, zdjęcia, prasę, plakaty oraz pocztówki.
Materiały pochodzą z II połowy XX w. i początków XXI w. Dotyczą zarówno Naukowego Koła Historyków Uniwersytetu Gdańskiego, jak i tematyki studenckiej, funkcjonowania Uniwersytetu Gdańskiego oraz nauki historycznej.